Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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