Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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