Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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