Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx11Q6AXC6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms