Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clcn1Q64347 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcn1Q64347 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcn1Q64347 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcn1Q64347 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcn1Q64347 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcn1Q64347 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcn1Q64347 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcn1Q64347 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcn1Q64347 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcn1Q64347 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcn1Q64347 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcn1Q64347 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcn1Q64347 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcn1Q64347 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcn1Q64347 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcn1Q64347 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcn1Q64347 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcn1Q64347 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcn1Q64347 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcn1Q64347 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms