Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Dnah12Q3V0Q1 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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Dnah12Q3V0Q1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Dnah12Q3V0Q1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Dnah12Q3V0Q1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Dnah12Q3V0Q1 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Dnah12Q3V0Q1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Dnah12Q3V0Q1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Dnah12Q3V0Q1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Dnah12Q3V0Q1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Dnah12Q3V0Q1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Dnah12Q3V0Q1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Dnah12Q3V0Q1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms