Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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Znf48Q3US17 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Znf48Q3US17 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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