Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam178bQ24JP3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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