Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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