Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms