Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NrepQ07475 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NrepQ07475 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NrepQ07475 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms