Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms