Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2bQ01097 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 326.9 ms