Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChgaP26339 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChgaP26339 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChgaP26339 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms