Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms