Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nr4a1P12813 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms