Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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