Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm20518E9Q548 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm20518E9Q548 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm20518E9Q548 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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