Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms