Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms