Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.1 ms