Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

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Length 490 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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