Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms