Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms