Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf180Q3U827 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf180Q3U827 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf180Q3U827 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf180Q3U827 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf180Q3U827 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf180Q3U827 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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