Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rpusd2Q149F1 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rpusd2Q149F1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rpusd2Q149F1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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