Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms