Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gabpb1Q00420 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms