Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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