Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms