Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 A630012P03Rik-202ENSMUST00000114854 1974 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Olfr169-204ENSMUST00000216070 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tmem258P61166 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms