Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab11bP46638 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms