Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CrygdP04342 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CrygdP04342 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 293.8 ms