Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CrxO54751 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
CrxO54751 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CrxO54751 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CrxO54751 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CrxO54751 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CrxO54751 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CrxO54751 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CrxO54751 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CrxO54751 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CrxO54751 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CrxO54751 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CrxO54751 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CrxO54751 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CrxO54751 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CrxO54751 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CrxO54751 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CrxO54751 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CrxO54751 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
CrxO54751 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms