Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms