Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms