Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms