Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms