Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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