Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Nectin3Q9JLB9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Nectin3Q9JLB9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Nectin3Q9JLB9 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Nectin3Q9JLB9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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Nectin3Q9JLB9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Nectin3Q9JLB9 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Nectin3Q9JLB9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Nectin3Q9JLB9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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