Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms