Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA2

Amt, Aminomethyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmtQ8CFA2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AmtQ8CFA2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms