Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccser1Q8C0C4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccser1Q8C0C4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms