Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms