Protein–RNA interactions for Protein: Q80VL3

Prickle3, Prickle planar cell polarity protein 3, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prickle3Q80VL3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prickle3Q80VL3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms