Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms