Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrhQ62361 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrhQ62361 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms