Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms