Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NrepQ07475 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms