Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoc2Q05020 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms